2005年8月，井冈山大学设立了高等教育研究所，开展校本研究。不过，那时的高等教育研究所作为副处级机构，挂靠在发展规划处。为了适应学校改革与发展的需要，2008年5月，高等教育研究所从发展规划处独立出来，成为校内独立的正处级机构，现设有正处级岗位1个，副处级岗位2个。目前，该所以兼职研究人员为主，专职为辅。该所作为高等教育的专门研究机构，目前工作职责主要包括：1．负责高等教育学的学科建设；2．负责工作课题，开展校本研究；3．发布高等教育改革与发展动态信息；4．加强与国内外高等教育研究机构、上级高等教育学会的联系与协作；5．完成校领导布置的其它工作。

近五年以来，该所专兼职研究人员在《高等教育研究》、《中国高等教育》等刊物上发表学术论文100多篇，主持教育部人文社科规划课题1项，教育部司局课题1项，省级社科规划课题4项，省级教育科学规划课题5项，出版学术专著4部，获得2008年第十一批江西省高校教学成果一等奖1项、二等奖1项。

该所负责人简介：付八军，男，1976年生，教育学博士，副教授。1999年，毕业于湘潭大学管理学院，获管理学学士；2001年，提前一年从湘潭大学哲史文化学院毕业，获历史学硕士学位，随后，在湖南省教育科学研究院从事调研与管理工作；2003年进入厦门大学教育研究院攻读博士学位，2006年博士毕业后，到中国教育报刊社从事编辑和新闻工作。当年10月，转入井冈山大学工作至今。目前，已在《高等教育研究》、《中国高等教育》、《江苏高教》、《高教探索》等刊物上发表学术论文50余篇；主持省级课题3项，参与国家级、省部级课题多项，出版学术专著1部。主要从事高等教育、教师教育研究。